2010年1月26日，國家稅務總局發(fā)布了《國家稅務總局關于建筑企業(yè)所得稅征管有關問題的通知》（國稅函[2010]39號）一文，文件按國稅發(fā)[2008]28號文精神，對跨地區(qū)（指跨省、自治區(qū)、直轄市和計劃單列市，下同）經(jīng)營建筑企業(yè)所得稅征收管理問題做出了三項明確規(guī)定：

　　第一、實行總、分機構(gòu)體制的跨地區(qū)經(jīng)營建筑企業(yè)應嚴格執(zhí)行國稅發(fā)[2008]28號文件規(guī)定，按照“統(tǒng)一計算、分級管理、就地預繳、匯總清算、財政調(diào)庫”的辦法計算繳納企業(yè)所得稅。

　　第二、建筑企業(yè)跨地區(qū)設立的不符合二級分支機構(gòu)條件的項目經(jīng)理部（包括與項目經(jīng)理部性質(zhì)相同的工程指揮部、合同段等），應匯總到總機構(gòu)或二級分支機構(gòu)統(tǒng)一計算，按照國稅發(fā)[2008]28號文件規(guī)定的辦法計算繳納企業(yè)所得稅。

　　第三、各地稅務機關自行制定的與本通知相抵觸的征管文件，一律停止執(zhí)行并予以糾正；對按照規(guī)定不應就地預繳而征收了企業(yè)所得稅的，要及時將稅款返還給企業(yè)。未按本通知要求進行糾正的，稅務總局將按照執(zhí)法責任制的有關規(guī)定嚴肅處理。

　　國稅函[2010]39號是企業(yè)所得稅法人稅制制度的重要體現(xiàn)，國家稅務總局面對地方各級稅務機關對建筑企業(yè)異地經(jīng)營稅源的爭奪，對建筑企業(yè)異地施工的所得稅征管體系作了上述規(guī)定，對跨地區(qū)經(jīng)營建筑企業(yè)而言，值得稱贊。

　　但僅僅幾個月以后，2010年4月19日國家稅務總局又發(fā)布了《國家稅務總局關于跨地區(qū)經(jīng)營建筑企業(yè)所得稅征收管理問題的通知》（國稅函[2010]156號）文，對建筑企業(yè)異地施工的所得稅管理模式進行了調(diào)整和補充。不少地方值得納稅人關注：

　　（一）堅持法人所得稅制原則下，對征管方式作出調(diào)整。

　　第一，國稅函[2010]156號重申國稅函[2010]39號中關于實行總、分機構(gòu)體制的跨地區(qū)經(jīng)營建筑企業(yè)需要就地預繳企業(yè)所得稅的規(guī)定：

　　實行總分機構(gòu)體制的跨地區(qū)經(jīng)營建筑企業(yè)應嚴格執(zhí)行國稅發(fā)[2008]28號文件規(guī)定，按照“統(tǒng)一計算，分級管理，就地預繳，匯總清算，財政調(diào)庫”的辦法計算繳納企業(yè)所得稅。

　　可見，企業(yè)所得稅法人稅制仍是建筑企業(yè)跨地區(qū)經(jīng)營企業(yè)所得稅征收管理所需遵循的基本精神。

　　第二，不就地預繳的不符合二級分支機構(gòu)條件的項目部范圍縮小。國稅函[2010]39號規(guī)定：建筑企業(yè)跨地區(qū)設立的不符合二級分支機構(gòu)條件的項目經(jīng)理部（包括與項目經(jīng)理部性質(zhì)相同的工程指揮部、合同段等），應匯總到總機構(gòu)或二級分支機構(gòu)統(tǒng)一計算，按照國稅發(fā)[2008]28號文件規(guī)定的辦法計算繳納企業(yè)所得稅。

　　國稅函[2010]156號規(guī)定：建筑企業(yè)所屬二級或二級以下分支機構(gòu)直接管理的項目部（包括與項目部性質(zhì)相同的工程指揮部、合同段等，下同）不就地預繳企業(yè)所得稅，其經(jīng)營收入、職工工資和資產(chǎn)總額應匯總到二級分支機構(gòu)統(tǒng)一核算，由二級分支機構(gòu)按照國稅發(fā)[2008]28號文件規(guī)定的辦法預繳企業(yè)所得稅。

　　上述變化可以看到，總機構(gòu)直接管理的不符合二級分支機構(gòu)條件的項目部排除在不就地預繳企業(yè)所得稅的范圍之外。

　　第三，規(guī)定了總機構(gòu)直接管理的跨地區(qū)設立的項目部預繳比例和方式。

　　國稅函[2010]156號規(guī)定：建筑企業(yè)總機構(gòu)直接管理的跨地區(qū)設立的項目部，應按項目實際經(jīng)營收入的0.2%按月或按季由總機構(gòu)向項目所在地預分企業(yè)所得稅，并由項目部向所在地主管稅務機關預繳。

　　例如，某建筑企業(yè)總公司設在北京，并在上海、杭州設有分公司（假設符合二級分支機構(gòu)的條件）?？倷C構(gòu)派出項目部在成都施工，上海分公司派出項目部在寧波施工，杭州分公司派出項目部在廣州施工。（假設成都、寧波、和廣州的項目部都不屬于二級分支機構(gòu)）

　　按國稅函[2010]39號規(guī)定，成都項目部的收入、費用、資產(chǎn)應納入總機構(gòu)統(tǒng)一計算，寧波項目部應納入上海分公司統(tǒng)一計算，廣州項目經(jīng)理部應納入杭州分公司統(tǒng)一計算，最后再按照國稅發(fā)[2008]28號文件進行操作。因此，該企業(yè)雖然在成都、寧波、和廣州設立了項目部，但是并不需要就地預繳企業(yè)所得稅。

　　但根據(jù)國稅函[2010]156號規(guī)定，成都項目部屬于總機構(gòu)直接管理的跨地區(qū)設立的，應按項目實際經(jīng)營收入的0.2%按月或按季由總機構(gòu)向項目所在地預分企業(yè)所得稅，并由項目部向所在地主管稅務機關預繳。

　　上述變化可以說是國家稅務總局，面對地方各級稅務機關稅源利益訴求，而作出妥協(xié)而產(chǎn)生的結(jié)果。但上述調(diào)整一方面堅持了法人所得稅制的原則，另一方體現(xiàn)了稅源地利益要求。

　　（二）對總機構(gòu)應匯總計算企業(yè)應納所得稅的預繳方法作出明確

　　國稅函[2010]156號分三種情況，對總機構(gòu)應匯總計算企業(yè)應納所得稅的預繳方法作出了明確：

　　（1）總機構(gòu)只設跨地區(qū)項目部的，扣除已由項目部預繳的企業(yè)所得稅后，按照其余額就地納；

　?。?）總機構(gòu)只設二級分支機構(gòu)的，按照國稅發(fā)[2008]28號文件規(guī)定計算總、分支機構(gòu)應繳納的稅款；

　?。?）總機構(gòu)既有直接管理的跨地區(qū)項目部，又有跨地區(qū)二級分支機構(gòu)的，先扣除已由項目部預繳的企業(yè)所得稅后，再按照國稅發(fā)[2008]28號文件規(guī)定計算總、分支機構(gòu)應繳納的稅款。

　　（三）重新強調(diào)外出經(jīng)營活動稅收管理證明

　　國稅函[2010]156號規(guī)定：跨地區(qū)經(jīng)營的項目部（包括二級以下分支機構(gòu)管理的項目部）應向項目所在地主管稅務機關出具總機構(gòu)所在地主管稅務機關開具的《外出經(jīng)營活動稅收管理證明》，未提供上述證明的，項目部所在地主管稅務機關應督促其限期補辦；不能提供上述證明的，應作為獨立納稅人就地繳納企業(yè)所得稅。同時，項目部應向所在地主管稅務機關提供總機構(gòu)出具的證明該項目部屬于總機構(gòu)或二級分支機構(gòu)管理的證明文件。

　　國稅函[2010]39號出臺后，不少人認為跨地區(qū)經(jīng)營的建筑企業(yè)所得稅的征收不再和外出經(jīng)營證明相掛鉤，無論是否開具外出經(jīng)營證明，都不存在建筑企業(yè)在施工項目所在地就地隨票附征企業(yè)所得稅的問題。但此次，國稅函[2010]156號重新強調(diào)外出經(jīng)營活動稅收管理證明，對上述觀點是當頭一棒。

　　重新強調(diào)外出經(jīng)營活動稅收管理證明，建筑企業(yè)會擔心無法擺脫《國家稅務總局關于建筑安裝企業(yè)所得稅納稅地點問題的通知》（國稅發(fā)[1995]227號）下將企業(yè)所得稅管理與外出經(jīng)營證掛鉤，被重復征稅的厄運。個別地方稅務機關必然會出于稅源利益保護的需要，緊緊抓住這個政策不放，對轄區(qū)內(nèi)的異地施工項目部征收企業(yè)所得稅。而項目部回到自己的總機構(gòu)所在地，總機構(gòu)所在地主管稅務機關認為這部分稅款并不符合國稅發(fā)[2008]28號文件的規(guī)定，不允許其抵繳被征稅款。

　　此外，國稅函[2010]156號對明確建筑企業(yè)辦理企業(yè)所得稅年度匯算清繳主體、附送資料、適用范圍以及執(zhí)行時間作出了規(guī)定：

　　建筑企業(yè)總機構(gòu)應按照有關規(guī)定辦理企業(yè)所得稅年度匯算清繳，各分支機構(gòu)和項目部不進行匯算清繳?？倷C構(gòu)年終匯算清繳后應納所得稅額小于已預繳的稅款時，由總機構(gòu)主管稅務機關辦理退稅或抵扣以后年度的應繳企業(yè)所得稅。

　　建筑企業(yè)總機構(gòu)在辦理企業(yè)所得稅預繳和匯算清繳時，應附送其所直接管理的跨地區(qū)經(jīng)營項目部就地預繳稅款的完稅證明。

　　建筑企業(yè)在同一省、自治區(qū)、直轄市和計劃單列市設立的跨地（市、縣）項目部，其企業(yè)所得稅的征收管理辦法，由各省、自治區(qū)、直轄市和計劃單列市國家稅務局、地方稅務局共同制定，并報國家稅務總局備案。

　　因此，建筑企業(yè)在統(tǒng)一省、自治區(qū)、直轄市或者計劃單列市范圍內(nèi)，跨地區(qū)經(jīng)營，其具體的征收辦法還要看所在地省、自治區(qū)、直轄市或者計劃單列市稅務機關的政策規(guī)定。

　　國稅函[2010]156號自2010年1月1日起施行，因此對建筑企業(yè)2009年度企業(yè)所得稅匯算清繳沒有影響。