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首先，在核定農產品增值稅進項稅額扣除比對方發(fā)票上的進項稅額多的情況下，根據《國家稅務總局關于執(zhí)行農產品增值稅進項稅額扣除政策有關問題的通知》（稅務審[2020]33號），要求納稅人按照實際生產的農業(yè)產品成本來計算可以扣除的進項稅額，并在納稅期間累計計算。如果累計的進項稅額數字高于發(fā)票上的實際進項稅額，那么納稅人可以把多出來的部分在尾月直接申報進項稅額扣除。 另外，在核定的過程中，納稅人還需要注意增值稅完稅憑證（發(fā)票、收據）的復核“三七分”法，即從發(fā)票面額、購貨時間、購貨方角度，來進行復核，并且要及時完成票據復核，以免出現漏抵或多抵現象。此外，納稅人還需要把每個月累計計算的進項稅額數字做記錄，以便日后審計查詢使用。 總的來說，納稅人在核定農產品增值稅進項稅額扣除比對方發(fā)票上的進項稅額多的情況下，除了要按照實際生產的農業(yè)產品成本來計算可以扣除的進項稅額外，還要注意復核增值稅完稅憑證，以及及時記錄累計計算的進項稅額數字。 拓展知識： 在2018年3月底出臺的《農產品增值稅進項稅額扣除政策實施細則》中，政府明確規(guī)定：由于農產品的價格波動，納稅人可以在累計收入比對累計費用的基礎上，按照實際發(fā)生的農產品成本計算每月可以扣除的農產品進項稅額，從而使企業(yè)能夠及時享受稅收優(yōu)惠。