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可以代開醫(yī)療器械發(fā)票，但因為醫(yī)療器械屬于特殊稅種，所以開發(fā)票時，有一定的規(guī)定要求，需要提供醫(yī)療器械購買憑證、批文復(fù)印件并填寫相應(yīng)表格，并經(jīng)過九宮格認證，符合條件后可以代開醫(yī)療器械發(fā)票。以北京市第七醫(yī)院抗病毒藥物采購為例，在開發(fā)票前首先需要拿到藥品的采購合同及采購單據(jù)，提供相應(yīng)的產(chǎn)品批文復(fù)印件，確保產(chǎn)品是正規(guī)進口或者正規(guī)生產(chǎn)的。然后，填寫《醫(yī)療器械發(fā)票種類稅率表》，登錄九宮格，最后需提供《九宮格稅控認證證明書》，經(jīng)過稅控系統(tǒng)認證后，方可開具醫(yī)療器械發(fā)票。