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根據(jù)《中華人民共和國企業(yè)所得稅法》第五條規(guī)定，企業(yè)應(yīng)當(dāng)依照本法及有關(guān)政策、規(guī)定，按期申報納稅，如果個體工商戶在年報時利潤填50000，則需要繳納企業(yè)所得稅。而在實際沒交過稅的情況下，根據(jù)《企業(yè)所得稅法》第六十六條規(guī)定，如果企業(yè)未按規(guī)定及時申報、繳納稅款的，稅務(wù)機(jī)關(guān)應(yīng)當(dāng)根據(jù)企業(yè)實際情況，采取核定征收的方式辦理。因此，個體工商戶在年報時利潤填50000，未按規(guī)定及時申報、繳納稅款，將由稅務(wù)機(jī)關(guān)采取核定征收的方式進(jìn)行處理。 拓展知識：根據(jù)《中華人民共和國企業(yè)所得稅法》第六十三條規(guī)定，企業(yè)應(yīng)當(dāng)申報月度預(yù)繳稅款。預(yù)繳稅款是企業(yè)在企業(yè)所得稅納稅義務(wù)發(fā)生之日起，按照有關(guān)稅率和計算方法，將本期應(yīng)納稅額的一定比例預(yù)先繳納到國庫的稅款。