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員工取得的年度績效工資在年終匯算清繳時，是否計入綜合所得取決于其選擇的計稅方式。 如果員工選擇將全年一次性獎金并入綜合所得計算納稅，則年度績效工資會作為綜合所得的一部分進行計稅。這種方式下，員工的年度績效工資將與其它工資薪金、勞務(wù)報酬等一起匯總，扣除相應(yīng)的費用和扣除項后，按照綜合所得的稅率來計算應(yīng)繳納的個人所得稅。 如果員工選擇不將全年一次性獎金并入綜合所得，而是單獨計稅，則年度績效工資不會計入綜合所得。在這種情況下，員工的年度績效工資將被視為一次性收入，按照特定的計算方法單獨計算稅額。具體來說，是以全年一次性獎金收入除以12個月得到的數(shù)額，按照按月?lián)Q算后的綜合所得稅率表確定適用稅率和速算扣除數(shù)，然后計算出應(yīng)納稅額