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親愛的學(xué)員，您好！很高興能為您提供幫助，您的問題答復(fù)如下：
1.將分公司人員的工資全部計入總公司研發(fā)費用并加計扣除可能不合理。
2.判斷依據(jù)包括：國家稅務(wù)總局公告2017年第40號 一、人員人工費用 指直接從事研發(fā)活動人員的工資薪金、基本養(yǎng)老保險費、基本醫(yī)療保險費、失業(yè)保險費、工傷保險費、生育保險費和住房公積金，以及外聘研發(fā)人員的勞務(wù)費用。 （一）直接從事研發(fā)活動人員包括研究人員、技術(shù)人員、輔助人員。研究人員是指主要從事研究開發(fā)項目的專業(yè)人員；技術(shù)人員是指具有工程技術(shù)、自然科學(xué)和生命科學(xué)中一個或一個以上領(lǐng)域的技術(shù)知識和經(jīng)驗，在研究人員指導(dǎo)下參與研發(fā)工作的人員；輔助人員是指參與研究開發(fā)活動的技工。外聘研發(fā)人員是指與本企業(yè)或勞務(wù)派遣企業(yè)簽訂勞務(wù)用工協(xié)議（合同）和臨時聘用的研究人員、技術(shù)人員、輔助人員。強調(diào)與本企業(yè)或勞務(wù)派遣企業(yè)簽訂協(xié)議
3.除了從設(shè)立分公司的章程分析外，還可以通過實際工作記錄、項目報告、工資單和績效評估等方面來判斷分公司人員的業(yè)務(wù)活動。
4.是的，加計扣除通常要求費用與研發(fā)“直接”相關(guān)。
5.“直接相關(guān)”一般指那些能夠明確歸屬于特定研發(fā)項目的支出，如研發(fā)人員的人工成本、材料費等。
6.例如，行政管理費用、銷售部門的市場調(diào)研費用（除非能證明這些活動是為某個具體的研發(fā)項目服務(wù)）、以及與日常運營相關(guān)的其他間接費用，即使它們對研發(fā)有支持作用，也不屬于直接相關(guān)。
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